Hugo,
Não há na bibliografia, tão pouco em publicações da Marinha, uma definição para Lagos e Lagoas. Alguns dicionários dizem apenas que lagoa é um lago pequeno. Na disso faz sentido se tomarmos como exemplo a Lagoa dos Patos no RS, pois ela é maior que qualquer lago do Brasil, e está ligada ao mar.
O seu entendimento está correto: “Marítimos operam embarcações classificadas tanto para nav em mar aberto quanto interior, ao passo que fluviários operam embarcações classificadas apenas para a navegação interior”
Eu acho que a R-Lesta é que está mal escrita.